承襲劇情漫畫獎獎勵台灣原創漫畫工作者，及挖掘新生代漫畫家的精神，對我國漫畫創作、推廣、行銷或人才培育有具體成效或貢獻的人或作品均為金漫獎主要獎勵的重點，行政院新聞局整合多方寶貴意見，及累積過去推廣國人漫畫活動的經驗，使金漫獎在推動國人動漫產業的道路上更具意義及成效，也是延續鼓勵本土漫畫創作的新指標。

獎勵項目
　　包含「最佳少年漫畫類獎」、「最佳少女漫畫類獎」、「最佳一般漫畫類獎」、「最佳漫畫潛力獎」、「最佳漫畫新人獎」（優勝、佳作各1名）; 「網路人氣獎」（1名）、「最佳年度漫畫大獎」（1名）、「終身成就獎」（1名）、「最佳年度漫畫貢獻獎」（3名）等九大獎項。

推廣活動
1. 金漫獎頒獎典禮
－8月12日於世貿展覽一館C區舉行

2. 金漫獎特展
－本屆金漫獎與中央研究院數位典藏攜手合作，將於「漫畫博覽會」（8月11日∼8月16日）及「國家圖書館藝術暨視聽資料中心」（6月13日∼9月18日）展出「99年金漫獎入圍作品」！展出內容：本屆參賽者作品、數位典藏CCC創意集影片、原畫等內容，希望讓廣大的參觀民眾瞭解到近年如雨後春筍般崛起的優秀台灣漫畫家，並認識台灣原創漫畫作品的魅力。

3. 金漫獎網路票選活動
－於6月24日∼7月31日，網友可在金漫獎官方網站提供的入圍者名單中，選出自己心目中認為的得獎者，預測獎項共有：一般、少年、少女、潛力、新人五項，得票數最高的漫畫家不但有機會獲得「網路人氣獎」，參加活動的網友更有機會獲得金漫娃限量公仔哦！（共100組）。

4. 北中南巡迴活動
－配合中華動漫出版同業協進會所舉辦的「10月動漫月」活動，運用全省店家通路，舉辦巡迴簽名會、邀請金漫獎得獎漫畫家做一日店長，以及設置金漫獎與劇情漫畫獎作品專櫃展出等活動，強力促銷台灣漫畫作品，期有效提升銷售量！

5. 海外推廣行銷
－將協助得獎作品報名角逐中國金龍獎、美猴獎等國際漫畫獎項，積極將台灣漫畫推向國際市場。

6. 校園巡迴推廣活動
－預計聯合校園社團，舉辦北中南校園推廣活動。希望讓學生能更了解金漫獎的活動宗旨，並鼓勵其踴躍投身於創作之中。